Природный комплекс Подосиновского района, в основу которого входит знаменитое Кайское болото, которое является водоразделом бассейнов рек Северного Ледовитого океана и Каспийского моря.
По территории района протекает 56 рек и речек, основными из которых являются Юг, Пушма, Молома. Реки района принадлежат к типу равнинных рек, для которых характерно смешанное питание с преобладанием снегового. Водозабор из поверхностных источников производит ООО «ЛПК «Полеко» в объеме 3042,55 тыс. м куб. в год.
На территории района насчитывается 158 водозаборных скважин, закрепленных за 34 недропользователями, из них 24 скважины расположены в районном центре. Глубина скважин от 30 м (п. Ровдино) до 179 м (д. Зубариха). Разведано несколько участков пресных подземных вод, которые можно использовать для розлива и производства.
Среди гидрологических памятников природы – многочисленные родники. Почти в центре пос. Подосиновец бьет родник с расходом воды 0,17 метров в секунду. Даже в жару температура воды в нем не превышает + 90 С.
По запасам подземных вод район можно отнести к высокообеспеченным.